军队都召回南岸。于是朝廷下诏让江北军队都移到江潭苑。侯景又奏称：“永安侯萧确、赵威方隔着围栅一个劲儿骂我，说什么‘天子他跟你订盟约，我们还是要追击你’。请把他们召回城，我就开拔。”朝廷便下令把他们都召回去。侯景遂即把东城的米运到石头城，军粮充足了。又上书说：“西岸来信，说高澄已占据寿春、钟离，我无处安身，先暂借广陵、谯州，等我把寿春、钟离夺回来，马上奉还朝廷广陵、谯州。”
当时荆州刺史湘东王萧绎驻军武成，河东王萧誉驻扎巴陵，前信州刺史桂阳王萧忄造顿兵江津，都不肯向前。后来有诏书叫他们班师，湘东王要回去，中记室参军萧贲说：“侯景作为人臣，举兵攻打皇宫，如今他如果解除武装回去，不等他渡江，小孩子都能杀了他，他一定不会罢兵的。大王带十万大兵，还没见贼兵就退回去，该怎么说呢。”湘东王不高兴。萧贲是个刚直的人，常对湘东王不去救援不满。他曾和萧绎玩双六，萧绎该吃却没有下子，萧贲一语双关地说：“殿下看来全然没有下的意思。”暗指他没有顺江而下解救朝廷之意。萧绎对他深为忌恨，后来找借口杀了他。
侯景已知援军号令不统一，都不肯为朝廷出力，又听说城中死的病的越来越多，估计一定会有人投降响应他。既退了湘东王等人的兵，又得到东城的粮米，王伟便对侯景进言：“大王作为人臣举兵造反，包围皇宫，已超过百日。威逼侮辱嫔妃公主，凌辱糟踏皇家宗庙，到了今日这步田地，还到哪里去容身？望大王暂且还是静观待变。”侯景认为他说得对。就上表陈述武帝的十大过失。太清三年(549)三月初一早上，城内在太极殿前设坛，命兼太宰、尚书仆射王克等昭告天地神灵，说侯景违背盟约，举烽火擂鼓呐喊。当初，台城被围时，城内有男女十余万，披甲者三万，到这时人已快病死完了，守城的只有二三千人，还都是羸弱怯懦的。街上躺满了死尸，无人掩埋，臭气传出好几里，死尸腐烂的汁水流满了沟沟洼洼。这时羊鸦仁、柳仲礼、鄱阳王太子萧嗣进军到东府城北。营垒的围栅还未建好，被侯景部将宋子仙战败，把砍下的头摆在皇城下面。侯景又派于子悦去求和，城内派御史丞沈峻到侯景处。侯景没有撤兵的意思，沈峻因此责备他，侯景大怒，马上决开石阙前的口子放水，百路攻城，日夜不停。
十三日，邵陵王太子萧坚的部下白昙朗、董勋华在城西北楼放贼入城，五更时，贼兵在城四周架上飞梯，一齐拥上，永安侯萧确和他哥哥萧坚力战不能退敌。就跑回文德殿报告情况。眨眼功夫，侯景已派王伟、仪同陈庆来到，上殿谢罪说：“臣侯景与高氏有仇隙，所以来归顺投奔，每次上书启奏都被扣压不报告朝廷，因此入朝。而奸邪之人害怕被杀，便对我拼命阻拦，以至于兴兵多日，臣罪该万死。”武帝问：“侯景现在在哪儿？可召他前来。”侯景入朝，带甲士五百人自卫，带剑上殿。叩拜完毕，武帝神色不变，让人引侯景坐三公的座位，问他：“你征战日久，太劳累了吧。”侯景没有吭声。又问：“你是哪州人？怎么来到这里？”侯景又答不上来。他的随从任约便替他回答。武帝又问：“你刚渡江时有多少人？”侯景答：“一千人。”问：“现在有多少人？”回答：“普天之下，都是我的人。”武帝低下头不说话。侯景出来，对他的厢公王僧贵说：“我经常跨马与敌对阵，刀箭交错，心里一点儿不觉得怕。如今看见萧公，却叫自己感到恐惧，难道不是天威难犯吗。我不能再见他了。”出来到永福省见简文帝。简文帝坐着和他相见，也没有害怕的样子。
当初，简文帝作《寒夕诗》说：“雪花无有蒂，冰镜不安台。”又有《咏月诗》道：“飞轮了无辙，明镜不安台。”后人认为这是谶语诗，说“无蒂”，就是无帝。“不安台”，就是台城不安。“轮无辙”，因为邵陵王名纶，空有来救援之名。
然后侯景屯兵西州，派伪仪同陈庆带甲兵看守太极殿，把皇宫的舆服器玩、后宫嫔妃都抢个净光，把王侯朝臣都集中起来送到永福省，撤掉皇帝与太子宫中侍卫。派王伟守武德殿，于子悦屯驻太极东堂，假借帝命下诏大赦，自立为大都督、都督中外诸军、录尚书事，他的侍中、使持节、大丞相、河南王职务不变。
原来，城中堆积的尸体没有功夫埋葬，还有死了没有收殓，或者是将死未死的，侯景命令都把他们堆在一块儿烧了，臭气传到十余里外。尚书外兵郎鲍正病重，贼兵把他也拉出来烧了，他在火里挣扎翻腾，很久才死去。侯景又假借帝命下令让州镇长官各回本处，于是各路军队都解散回去。降萧正德为侍中、大司马，百官各复其职。
武帝虽然外表已屈服，而心怀愤恨。侯景想让宋子仙当司空，武帝说：“调和阴阳，岂在这东西。”侯景又请让文德主帅邓仲为城门校尉，武帝：“不设这官职。”简文帝又来奏请此事，武帝发怒说：“谁叫你来的！”侯景听说了也不敢逼迫。后来每次要求办什么事，多不符合武帝意思而不被答应，于是武帝的膳食也被裁减克扣，武帝心中更加忧愤。五月，因病饿在文德殿驾崩。侯景保密不公布丧讯，暂时把灵柩放在昭阳殿，外边的文武官员谁也不知道。过了二十多天，才把武帝灵柩抬到太极前殿，迎简文帝即位。等把武帝葬在。。陵时，让卫士用大钉在风水紧要处钉上，想让武帝断绝后世。侯景假借朝廷命令赦免作奴婢的北方人，想让他们给自己出力。当时东扬州刺史临城公萧大连、吴兴太守张山乘都各守自己州郡，自南陵以南地方官各守其地，侯景的命令所能实行的地区，只有吴郡以西、南陵以北而已。
六月，侯景在永福省杀萧正德，封元罗为西秦王，元景袭为陈留王，各元姓子弟封王的有十余人。委任柳仲礼为使持节、大都督，隶属大丞相管辖，参与军事。
十一月，百济国使臣到此，见到城市已成废墟，在端门外号哭，行路人看到的无不流泪。侯景听说大怒，把他们关进小庄严寺，禁止出入。
大宝元年(550)正月，侯景借皇帝名义给自己加班剑随从四十人，赐给自己前后部羽葆、鼓吹，设置左右长史、从事中郎四人。三月甲申日，侯景请简文帝到乐游苑水边举行沐浴仪式并设宴，在帐中畅饮三天。他的党羽都带了老婆孩子同去，皇太子以下，被命令都要骑马射箭，射中的赏给金钱。第二天天快亮时，简文帝要回宫，侯景拜伏苦苦请他留下，简文帝不答应。他走以后，侯景就和溧阳公主一起在御床上并排面南而坐，文武群臣分列就座陪同饮宴。
四月十二日，侯景又叫简文帝到西州去，简文帝坐着没有彩饰的车子，侍卫四百余人。侯景那帮人带数千铁骑两旁护卫。简文帝到西州，侯景等人迎拜。简文帝头戴下屋白纱帽，身穿白布裙袄。侯景穿紫绸骑服，腰系金带，和他的伪仪同陈庆、索超世等面向西而坐。溧阳公主和她母亲范淑妃面向东坐。简文帝听到奏乐声，凄然下泪。侯景起身问候说：“陛下为什么不高兴了呢？”简文帝对他笑笑问：“丞相说索超世听到这以为是什么音乐？”侯景回答：“我尚且不知道，何况超世呢。”简文帝就让侯景起舞，侯景于是离席跟着弦乐唱起来。简文帝又回头让淑妃歌舞，淑妃一再推辞才作罢。侯景又起来行礼，逼简文帝跳舞。喝完酒众人散去后，简文帝坐在床上抱住侯景说：“我怜爱丞相。”侯景说：“陛下如不怜爱我，我怎能到这一步。”简文帝让人给他拿过来筌蹄，说：“我给你讲经。”命侯景离开座席，让他唱经。侯景问索超世什么经最小，超世说：“只有《观世音》小。”侯景就唱：“尔时无尽意菩萨。”简文帝大笑，到夜间才散。